L’administration à Zurich est un prestataire de service pour les communautés (paroisses) et la direction de l’Église. Elle garantit l’observation des conditions-cadres organisationnelles et juridiques. L’objectif des collaborateurs de l’administration et des secrétariats est de faciliter le travail des ministres chargés de la pastorale et des personnes mandatées sur place, en les déchargeant de certaines activités administratives. 

L’administration gère les intérêts des quelque 400 paroisses (communautés) avec 57'000 membres dans 15 pays. Cependant, et comme par le passé, l’engagement bénévole des membres et des ministres de l’Église néo-apostolique constitue l’épine dorsale de la vie ecclésiale, la racine du fonctionnement de l’Église.

L’apôtre de district Jürg Zbinden est le ministre suprême du champ d’activité d’apôtre de district et en même temps le président de l’Église territoriale de Suisse. Il est en charge des domaines de la pastorale et de l’administration.